L'effetto positivo dell'agopuntura è dato da vari meccanismi,
tra cui la generazione di sostanze endogene (endorfine) e sostanze che trasmettono l'impulso nervoso (neurotrasmettitori). Queste sostanze svolgono un effetto lenitivo e rilassante a livello psichico.
L'agopuntura non è soltanto un metodo di rapida efficacia per la riduzione del dolore, ma ha un effetto rilassante, supporta il sistema immunitario e attiva il sistema motorio. Tuttavia, l'agopuntura è in grado solo di guarire i disturbi, non ciò che è irreparabilmente danneggiato. La corretta esecuzione dell'agopuntura non sortisce alcun effetto indesiderato, ma in alcuni casi isolati possono insorgere malessere, vertigini, cefalee o dolori locali.